MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella

Total Repeats: 16980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018605	TTA	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409913918
2	NC_018605	ACT	3	9	99	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409913918
3	NC_018605	TTA	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409913918
4	NC_018605	A	7	7	143	149	100 %	0 %	0 %	0 %	409913918
5	NC_018605	A	7	7	185	191	100 %	0 %	0 %	0 %	409913918
6	NC_018605	TA	3	6	223	228	50 %	50 %	0 %	0 %	409913918
7	NC_018605	CTA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409913918
8	NC_018605	TTTTCT	2	12	296	307	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	409913918
9	NC_018605	CTT	2	6	310	315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409913918
10	NC_018605	TAA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409913918
11	NC_018605	CAT	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409913918
12	NC_018605	GAA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409913918
13	NC_018605	GATG	2	8	732	739	25 %	25 %	50 %	0 %	406024903
14	NC_018605	GCT	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024903
15	NC_018605	GTT	2	6	792	797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406024903
16	NC_018605	TCC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406024903
17	NC_018605	ATG	2	6	914	919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024903
18	NC_018605	TAAA	2	8	995	1002	75 %	25 %	0 %	0 %	406024903
19	NC_018605	T	7	7	1018	1024	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
20	NC_018605	TGCA	2	8	1040	1047	25 %	25 %	25 %	25 %	406024903
21	NC_018605	ATT	2	6	1077	1082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024903
22	NC_018605	T	6	6	1127	1132	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
23	NC_018605	CAG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024903
24	NC_018605	T	6	6	1218	1223	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
25	NC_018605	T	8	8	1276	1283	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
26	NC_018605	TCT	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024903
27	NC_018605	TA	5	10	1374	1383	50 %	50 %	0 %	0 %	406024903
28	NC_018605	CTA	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024903
29	NC_018605	ACG	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024903
30	NC_018605	TTC	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024903
31	NC_018605	TAA	2	6	1576	1581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024903
32	NC_018605	GTA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024903
33	NC_018605	TTA	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024903
34	NC_018605	T	7	7	1627	1633	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
35	NC_018605	T	6	6	1815	1820	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
36	NC_018605	T	6	6	1836	1841	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
37	NC_018605	ATTT	2	8	1845	1852	25 %	75 %	0 %	0 %	406024903
38	NC_018605	ATC	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024903
39	NC_018605	T	6	6	1937	1942	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
40	NC_018605	T	6	6	1980	1985	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
41	NC_018605	TCA	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024903
42	NC_018605	T	6	6	2069	2074	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
43	NC_018605	T	7	7	2089	2095	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
44	NC_018605	T	8	8	2111	2118	0 %	100 %	0 %	0 %	406024903
45	NC_018605	AT	4	8	2127	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	406024903
46	NC_018605	CAC	2	6	2145	2150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024903
47	NC_018605	TCT	2	6	2155	2160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024903
48	NC_018605	TAG	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024903
49	NC_018605	TTC	2	6	2328	2333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024903
50	NC_018605	TGG	2	6	2397	2402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406024903
51	NC_018605	AGATC	2	10	2407	2416	40 %	20 %	20 %	20 %	406024903
52	NC_018605	ATTTTT	2	12	2500	2511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406024903
53	NC_018605	TATG	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	406024904
54	NC_018605	CA	3	6	2793	2798	50 %	0 %	0 %	50 %	406024904
55	NC_018605	TCA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024904
56	NC_018605	ATA	2	6	2910	2915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024904
57	NC_018605	T	7	7	2953	2959	0 %	100 %	0 %	0 %	406024904
58	NC_018605	CTA	2	6	2989	2994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024904
59	NC_018605	TA	3	6	3038	3043	50 %	50 %	0 %	0 %	406024904
60	NC_018605	ATG	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024904
61	NC_018605	GCT	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024904
62	NC_018605	TTA	2	6	3104	3109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024904
63	NC_018605	ATA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024904
64	NC_018605	ATTT	2	8	3195	3202	25 %	75 %	0 %	0 %	406024904
65	NC_018605	CCAT	2	8	3384	3391	25 %	25 %	0 %	50 %	406024904
66	NC_018605	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024904
67	NC_018605	CAA	2	6	3506	3511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024904
68	NC_018605	GAA	2	6	3557	3562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024904
69	NC_018605	GAACT	2	10	3582	3591	40 %	20 %	20 %	20 %	406024904
70	NC_018605	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024904
71	NC_018605	TA	3	6	3650	3655	50 %	50 %	0 %	0 %	406024904
72	NC_018605	AGG	2	6	3769	3774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406024904
73	NC_018605	AAC	2	6	3864	3869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024904
74	NC_018605	CCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024904
75	NC_018605	CTG	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024904
76	NC_018605	GTCC	2	8	3989	3996	0 %	25 %	25 %	50 %	406024904
77	NC_018605	A	7	7	4045	4051	100 %	0 %	0 %	0 %	406024904
78	NC_018605	ACC	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024904
79	NC_018605	AGA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024904
80	NC_018605	TAC	2	6	4230	4235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024904
81	NC_018605	AAG	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024904
82	NC_018605	TAG	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024904
83	NC_018605	ATG	2	6	4548	4553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024904
84	NC_018605	A	7	7	4600	4606	100 %	0 %	0 %	0 %	406024904
85	NC_018605	AAAAT	2	10	4638	4647	80 %	20 %	0 %	0 %	406024904
86	NC_018605	A	7	7	4714	4720	100 %	0 %	0 %	0 %	406024904
87	NC_018605	CAG	2	6	4721	4726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024904
88	NC_018605	AAG	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024905
89	NC_018605	TAA	2	6	5205	5210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024905
90	NC_018605	TTTA	2	8	5242	5249	25 %	75 %	0 %	0 %	406024905
91	NC_018605	AGG	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406024905
92	NC_018605	AAAC	2	8	5278	5285	75 %	0 %	0 %	25 %	406024905
93	NC_018605	A	8	8	5354	5361	100 %	0 %	0 %	0 %	406024905
94	NC_018605	AG	3	6	5365	5370	50 %	0 %	50 %	0 %	406024905
95	NC_018605	AAGGC	2	10	5376	5385	40 %	0 %	40 %	20 %	406024905
96	NC_018605	AGC	2	6	5392	5397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
97	NC_018605	TCCG	2	8	5410	5417	0 %	25 %	25 %	50 %	406024905
98	NC_018605	AGA	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024905
99	NC_018605	GTA	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024905
100	NC_018605	ATA	2	6	5498	5503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024905
101	NC_018605	GAA	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024905
102	NC_018605	CAG	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
103	NC_018605	CAG	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
104	NC_018605	AGC	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
105	NC_018605	ACC	3	9	5674	5682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024905
106	NC_018605	CAG	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024905
107	NC_018605	GGT	2	6	5774	5779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406024905
108	NC_018605	GTC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024905
109	NC_018605	ACA	3	9	5830	5838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024905
110	NC_018605	AAT	2	6	5843	5848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024905
111	NC_018605	AAT	2	6	5867	5872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024905
112	NC_018605	TAC	2	6	5878	5883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024905
113	NC_018605	AATC	2	8	5942	5949	50 %	25 %	0 %	25 %	406024905
114	NC_018605	ATA	2	6	6202	6207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024906
115	NC_018605	TTTA	2	8	6473	6480	25 %	75 %	0 %	0 %	406024907
116	NC_018605	ACCA	2	8	6514	6521	50 %	0 %	0 %	50 %	406024907
117	NC_018605	CCT	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406024907
118	NC_018605	AAT	2	6	6582	6587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024907
119	NC_018605	A	7	7	6709	6715	100 %	0 %	0 %	0 %	406024907
120	NC_018605	TACAA	2	10	6869	6878	60 %	20 %	0 %	20 %	406024907
121	NC_018605	ACC	2	6	6887	6892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024907
122	NC_018605	GTT	2	6	7039	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406024907
123	NC_018605	TA	3	6	7056	7061	50 %	50 %	0 %	0 %	406024907
124	NC_018605	AT	3	6	7091	7096	50 %	50 %	0 %	0 %	406024907
125	NC_018605	TAT	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406024907
126	NC_018605	A	6	6	7164	7169	100 %	0 %	0 %	0 %	406024907
127	NC_018605	GTA	2	6	7176	7181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024907
128	NC_018605	TCAA	2	8	7192	7199	50 %	25 %	0 %	25 %	406024907
129	NC_018605	GCAA	2	8	7266	7273	50 %	0 %	25 %	25 %	406024907
130	NC_018605	AT	3	6	7532	7537	50 %	50 %	0 %	0 %	406024908
131	NC_018605	CTA	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024908
132	NC_018605	TTTA	2	8	7586	7593	25 %	75 %	0 %	0 %	406024908
133	NC_018605	AGCCA	2	10	7670	7679	40 %	0 %	20 %	40 %	406024908
134	NC_018605	AGC	2	6	7742	7747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024908
135	NC_018605	GTT	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406024908
136	NC_018605	A	6	6	7918	7923	100 %	0 %	0 %	0 %	406024908
137	NC_018605	CTTA	2	8	7977	7984	25 %	50 %	0 %	25 %	406024908
138	NC_018605	AGTC	2	8	8036	8043	25 %	25 %	25 %	25 %	406024908
139	NC_018605	TC	3	6	8059	8064	0 %	50 %	0 %	50 %	406024908
140	NC_018605	A	9	9	8096	8104	100 %	0 %	0 %	0 %	406024908
141	NC_018605	T	6	6	8109	8114	0 %	100 %	0 %	0 %	406024908
142	NC_018605	GAA	3	9	8148	8156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024908
143	NC_018605	CAA	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024908
144	NC_018605	ACC	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406024908
145	NC_018605	AGCAGA	2	12	8189	8200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406024908
146	NC_018605	A	7	7	8264	8270	100 %	0 %	0 %	0 %	406024908
147	NC_018605	AGT	2	6	8319	8324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024908
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150	NC_018605	TCA	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024908
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152	NC_018605	ATAGT	2	10	8464	8473	40 %	40 %	20 %	0 %	406024908
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154	NC_018605	TAG	2	6	8617	8622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024909
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156	NC_018605	ACA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406024909
157	NC_018605	GAT	2	6	8667	8672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024909
158	NC_018605	AGC	2	6	8689	8694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024909
159	NC_018605	ATCT	2	8	8724	8731	25 %	50 %	0 %	25 %	406024909
160	NC_018605	GCAA	2	8	8945	8952	50 %	0 %	25 %	25 %	406024910
161	NC_018605	ATATA	2	10	8953	8962	60 %	40 %	0 %	0 %	406024910
162	NC_018605	TA	4	8	8959	8966	50 %	50 %	0 %	0 %	406024910
163	NC_018605	TAG	2	6	8985	8990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
164	NC_018605	TTTA	2	8	9022	9029	25 %	75 %	0 %	0 %	406024910
165	NC_018605	AAAC	2	8	9110	9117	75 %	0 %	0 %	25 %	406024910
166	NC_018605	GAT	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
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172	NC_018605	CAG	3	9	9329	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406024910
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174	NC_018605	GCACT	2	10	9393	9402	20 %	20 %	20 %	40 %	406024910
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181	NC_018605	ATA	2	6	9636	9641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406024910
182	NC_018605	A	6	6	9656	9661	100 %	0 %	0 %	0 %	406024910
183	NC_018605	ATG	2	6	9693	9698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024910
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198	NC_018605	CTA	2	6	10569	10574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406024911
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253	NC_018605	ATG	2	6	13641	13646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024914
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260	NC_018605	CTT	2	6	13883	13888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024914
261	NC_018605	ATG	2	6	13993	13998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406024914
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263	NC_018605	TCT	2	6	14047	14052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024914
264	NC_018605	CTT	2	6	14195	14200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024914
265	NC_018605	GCT	2	6	14221	14226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406024914
266	NC_018605	T	6	6	14289	14294	0 %	100 %	0 %	0 %	406024914
267	NC_018605	TGG	2	6	14306	14311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406024914
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273	NC_018605	T	7	7	14861	14867	0 %	100 %	0 %	0 %	406024915
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277	NC_018605	AT	3	6	15220	15225	50 %	50 %	0 %	0 %	406024916
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279	NC_018605	T	6	6	15351	15356	0 %	100 %	0 %	0 %	406024916
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288	NC_018605	TAAAA	2	10	15795	15804	80 %	20 %	0 %	0 %	406024916
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391	NC_018605	TA	3	6	21112	21117	50 %	50 %	0 %	0 %	406024919
392	NC_018605	CTT	2	6	21280	21285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406024919
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394	NC_018605	AAG	2	6	21373	21378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406024919
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